Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LUMP51884 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LUMP51884 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LUMP51884 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms