Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX1P48742 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX1P48742 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms