Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms