Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIP4K2AP48426 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIP4K2AP48426 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms