Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GNPDA1P46926 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms