Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRXP46100 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRXP46100 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRXP46100 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms