Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCR1P46094 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XCR1P46094 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCR1P46094 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCR1P46094 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCR1P46094 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCR1P46094 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCR1P46094 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCR1P46094 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms