Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP5P45974 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP5P45974 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP5P45974 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP5P45974 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP5P45974 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP5P45974 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms