Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRATP43155 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRATP43155 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRATP43155 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRATP43155 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRATP43155 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRATP43155 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRATP43155 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms