Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NSG1P42857 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSG1P42857 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NSG1P42857 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NSG1P42857 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NSG1P42857 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NSG1P42857 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms