Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms