Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC4P35249 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC4P35249 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC4P35249 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC4P35249 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC4P35249 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC4P35249 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC4P35249 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms