Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RYKP34925 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RYKP34925 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RYKP34925 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RYKP34925 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms