Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRS3P32247 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRS3P32247 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms