Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFNP31947 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFNP31947 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFNP31947 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFNP31947 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFNP31947 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFNP31947 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFNP31947 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFNP31947 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFNP31947 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFNP31947 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms