Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MARCKSP29966 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARCKSP29966 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARCKSP29966 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARCKSP29966 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARCKSP29966 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms