Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMOD1P29536 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms