Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1EP28566 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms