Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXD10P28358 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms