Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSFA2P28290 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSFA2P28290 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms