Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMB5P28074 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB5P28074 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms