Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO2P25791 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO2P25791 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO2P25791 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO2P25791 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms