Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms