Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM21P19474 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms