Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB4P17483 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB4P17483 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms