Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB9P17482 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms