Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM27P14373 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM27P14373 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms