Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR2AP13861 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR2AP13861 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR2AP13861 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAR2AP13861 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAR2AP13861 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms