Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF35P13682 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms