Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA4P13612 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms