Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD8P13378 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD8P13378 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD8P13378 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD8P13378 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms