Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN1P12814 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN1P12814 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms