Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RLBP1P12271 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RLBP1P12271 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms