Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms