Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALAP11233 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALAP11233 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALAP11233 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RALAP11233 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALAP11233 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALAP11233 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALAP11233 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALAP11233 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALAP11233 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms