Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD28P10747 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD28P10747 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD28P10747 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD28P10747 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD28P10747 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms