Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR2F1P10589 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms