Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM225BP0DP42 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms