Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms