Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RGPD1P0DJD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RGPD1P0DJD0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms