Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms