Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47B1P0C2W7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms