Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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