Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTMAP06454 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTMAP06454 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTMAP06454 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms