Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTA1P02549 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms