Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-DQB1P01920 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms