Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf47O95873 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms