Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms