Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG7O95352 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG7O95352 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG7O95352 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG7O95352 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG7O95352 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG7O95352 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG7O95352 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG7O95352 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG7O95352 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms