Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATE1O95260 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATE1O95260 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATE1O95260 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATE1O95260 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms